中新上海網(wǎng)7月13日電(何高奇)日前，華東理工大學(xué)上海市新藥設(shè)計(jì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室推出國(guó)內(nèi)首個(gè)基于分子三維相似性的藥物設(shè)計(jì)圖形用戶界面系統(tǒng)。

　　這一名為eSHAFTS的軟件包由華東理工大學(xué)藥學(xué)院李洪林課題組和信息學(xué)院何高奇課題組歷經(jīng)兩年合作開(kāi)發(fā)而成，涵蓋了靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)及識(shí)別、先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)及優(yōu)化等功能，可滿足目前國(guó)內(nèi)外藥物發(fā)現(xiàn)的計(jì)算和研究需要，便于藥物設(shè)計(jì)專業(yè)及化學(xué)、生物學(xué)等非藥物設(shè)計(jì)專業(yè)科研人員使用。

　　“這種基于分子三維相似性的藥物設(shè)計(jì)方法，不依賴于靶標(biāo)蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)，便可完成藥物發(fā)現(xiàn)過(guò)程中的虛擬篩選和骨架躍遷等功能，進(jìn)而指導(dǎo)后面的化學(xué)結(jié)構(gòu)修飾及改造。”李洪林教授介紹說(shuō)，該軟件自發(fā)布以來(lái)，其精確的計(jì)算結(jié)果和優(yōu)越的計(jì)算性能得到用戶的積極反饋。

　　藥物設(shè)計(jì)技術(shù)作為一種實(shí)用化的工具，已經(jīng)介入到藥物研究的各個(gè)環(huán)節(jié)，并成為創(chuàng)新藥物研究的核心技術(shù)之一。但由于我國(guó)藥物設(shè)計(jì)軟件的集成和開(kāi)發(fā)發(fā)展都相對(duì)較晚，國(guó)內(nèi)科研工作者多依賴國(guó)外公司的專業(yè)軟件。

　　在國(guó)家“863”計(jì)劃資助下成功開(kāi)發(fā)的eSHAFTS軟件，是國(guó)內(nèi)首個(gè)三維相似性評(píng)價(jià)軟件。這種交互式圖形系統(tǒng)基于C/S模式，設(shè)計(jì)了高效的通信中間件和用戶工作流，可同時(shí)支持客戶端的交互計(jì)算以及服務(wù)器端的服務(wù)和計(jì)算，同國(guó)際上現(xiàn)有的商業(yè)化軟件相比，如基于形狀的三維分子相似性篩選程序ROCS、Schrödinger公司的ShapeScreening模塊等相比，具有界面友好、易于操作、計(jì)算精確度高等優(yōu)點(diǎn)。

　　上海市新藥設(shè)計(jì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室依托華東理工大學(xué)藥學(xué)院，以藥學(xué)學(xué)科為基礎(chǔ)，以信息為導(dǎo)向，結(jié)合華理相關(guān)研究方向，開(kāi)展創(chuàng)新藥物基礎(chǔ)及應(yīng)用方面研究，2011年11月經(jīng)上海市科委批準(zhǔn)建設(shè)，2013年10月通過(guò)驗(yàn)收，現(xiàn)屆學(xué)術(shù)委員會(huì)主任為沈寅初院士，李洪林教授為現(xiàn)任實(shí)驗(yàn)室主任。